橡膠草基因組序列獲解析
天然橡膠是與石油、鋼鐵、煤炭并重的世界四大工業原料之一,2015年全球耗費總量達12.14百萬噸,產值約170億美圓。巴西三葉橡膠樹是天然橡膠的主要來源,由于種植面積限制、消費本錢增加、遺傳背景狹窄和病蟲害重大等因素,橡膠消費逐漸難以滿足需求。我國是天然橡膠消費大國,而巴西三葉橡膠樹可種植面積極少,招致我國對外依賴度已超越80%。開發消費天然橡膠的代替資源具有重要的策略意義和經濟價值。
橡膠草Taraxacum kok-saghyz(TKS),又名俄羅斯蒲公英,是多年生的二倍體草本植物,根部可合成高分子量的天然橡膠和菊糖,具有成長范圍廣,天然橡膠含量高,成長周期較短,相對簡略的基因組和遺傳轉化與基因編輯比較容易等特點,被認為是最有可能成為代替消費天然橡膠的經濟作物和科學鉆研的形式植物。世界各國相繼成立了天然橡膠鉆研方案,如美國 “卓越方案”、歐盟 “珍珠方案”與“DRIVE4EU方案” 、德國的“RUBIN方案”等。我國則鉆研相對較少,2015年4月中國“蒲公英橡膠產業技術創新策略聯盟”正式成立。
中國科學院遺傳與發育生物學鉆研所李家洋鉆研組通過PacBio單分子實時(SMRT)測序技術獨立組裝完成了高質量的橡膠草基因組草圖,該基因組大小為1.29Gb,包含46,000多個基因和~70%反復序列。橡膠草基因組也是目前可以產生高分子量橡膠的植物中惟一完成基因組測序的草本植物。通過產膠植物與非產膠植物之間的比較基因組鉆研,鑒定了橡膠草中橡膠合成門路和菊糖合成門路,并闡述了橡膠鏈延長過程中CPT/CPTL和REF/SRPP兩個重要基因家族的進化歷程。此外,他們發現了橡膠草基因組中與自交衰退相關的可能候選區域。該成績標記著以橡膠草作為形式植物停止天然橡膠合成鉆研進入后基因組時代,并將大大加速橡膠草從野生植物向經濟作物的馴化,推動我國天然橡膠產業的開展。鉆研成績在線發表在National Science Review雜志上。
該鉆研得到了遺傳發育所自主課題、博士后創新人才支持方案和植物基因學國家重點實驗室青年鉆研基金的贊助。
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橡膠草及橡膠合成門路示用意
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